手把手教你用ggsci包绘制不同杂志风格的图形

2019-10-28 18:22:41 浏览数 (2)

各位科研芝士的小伙伴,今天给大家分享可视化专题学术期刊配色的绘制,我们的目标是学会Nature Publishing Group,American Association for the Advancement of Science,The New England Journal of Medicine,Lancet Oncology,The Journal of the American Medical Association,Journal of Clinical Oncology学术杂志的SCI论文图片风格的绘制,比如Nature杂志的出版的图片风格如下:

看到这两张图是不是突然觉得有一种眼前一亮的感觉,欲画此图,必装其包,今天的主角便是ggsci包

01

安装加载ggsci包,直接install和library即可

02

加载demo数据和需要的工具包ggplot2,gridExtra,demo数据是diamonds数据集。

本质上讲ggsci只是ggplot2的拓展包而已 ,所以必须要加载ggplot2

03

绘制一个散点图

首先采用ggplot2绘制一个散点图,可以看到x轴为table,y轴为price,用cut来映射颜色:

原始图形如下:

04

转成NPG杂志的风格图片

这个时候很简单,只需要增加一个图层而已,一行代码搞定,如下:

结果如下:

05

在绘制一个柱状图试一下NPG风格

结果:

06

更换杂志该怎么调颜色呢?

只需要更改scale_color_npg()后面的字母就行了,如果是American Association for the Advancement of Science,则是aaas,如果是The New England Journal of Medicine,则是nejm,Lancet Oncology是lancet,The Journal of the American Medical Association是jama,Journal of Clinical Oncology是jco,代码如下:

结果如下:

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