ERP不只是一个软件系统，而是一种基于信息技术的全新的现代企业管理思想和方法。
因此，在ERP的应用中就要体现这种全新的管理理念，对传统的经营方式进行根本性的变革，使其更加合理化、科学化，从而使得企业的经营方式与这种理念达到完美的和谐。
然而，传统的企业经营是基于人力手工运作的一套业务流程，有着金字塔状的组织结构，各职能管理机构重叠、中间层次多。特别是我国的许多国有企业，还没有完全从传统的计划经济经营方式转变到市场经济经营方式上来，他们的管理方法和管理手段也很落后。而ERP是从国外引进的一种运行于典型市场经济模式的系统，与国内企业的经营流程有着很大的区别，这就要求企业在应用ERP之前，首先要进行业务流程的重组，按照ERP的管理要求对现有的业务流程进行根本性的改造。其实很多成功实施ERP的企业，其效益的提高，一方面是来自于ERP软件本身，另一方面还得益于业务流程重组。
另外，ERP软件的应用改变了我们传统的经营管理方式，它将企业的经营管理活动按照其功能分为像采购、制造、销售、财务、库存等几大模块，它们的功能实现无疑要求企业对原有的组织机构、人员设置、工作流程进行重新的安排，以保证ERP功能的实现。 从根本上讲，企业应用ERP的目的在于改善企业的经营管理，提高企业经济效益。 系统是工具，企业自身的管理体系才是根本，因此不能只为了系统而实施系统，应该立足管理的本质去改善流程和应用系统。 对任何企业来说，在它现有的业务流程中都会存在着一些不合理的地方，如果不能够首先对这些不合理的流程进行彻底改造，而仅仅是盲目地将原有的业务流程通过ERP软件的实施进行自动化转变，则ERP实施的效果必然不尽人意。
