一般我们做生信的单因素或者多因素cox分析时,都会制作一个三线表,如下图所示:
这一类三线表的数据来源和如何绘制,在我前期的视频中已经做过了。有兴趣的可有看一下R语言与生信系列①R入门与临床三线表绘制。但是我们有时需要绘制稍微高级一点,或者说是美观一点的森林图来替换三线表。比如下图
这一类的森林图与三线表的区别就是,将HR值及其可信区间用点和线段绘画出来。当然这类图不仅可以用于单因素或者多因素cox分析的绘制,更多的人将其应用于meta分析,如下图
实战
- 读取数据
setwd('D:\train\forest')
library(forestplot)
cox_forest <- read.csv('cox.csv',header = F)
- 绘制森林图