易生信培训开展了一年了,开了12期课程,固定的课程是二代转录组测序(包含单细胞)、扩增子分析及功能预测和宏基因组数据分析。
后台有很多粉丝留言希望可以多开设几个专题的培训,为响应大家需求,易生信计划在2019年新添三门课程:
一、群体遗传分析(重测序)
群体重测序主要分为两大方向:GWAS-关联分析和群体进化。GWAS主要用于基因型和表型数据的关联分析,是当前QTL定位最流行的方法之一。群体进化时利用群体遗传的理论方法和分析技术在群体层面上解决与进化、群体历史以及自然选择等相关的科学问题。其中选择分析是群体进化中最重要的模块之。目前很多群体重测序方面的研究也有很多是采用GWAS 群体进化的方案进行研究,相关文章一般都会发表在高影响因子的期刊。
二、代谢组学关联分析
调节生命活动的上游大分子(核酸、蛋白质等)的功能变化最终会体现在代谢层面,如神经递质的变化、激素调控、细胞信号释放等,所以代谢组提供的是生物学的终端信息。代谢组学是生命科学热门研究领域之一,其研究纷繁复杂、种类繁多,实验得到的数据也相当惊人。一般来说代谢组分析流程是:首先将代谢组份进行预处理,预处理的方法又需要由测量分析来决定;接着再对预处理后的组份进行定性和定量分析。再根分子水平数据进行关联分析,找到引起特定代谢图谱的分子机制。
三、基因家族和调控区域进化分析
最近基因家族分析很热门,有很多报道说做基因家族分析不用做实验就能发SCI?这当然不一定,有的人掌握了分析套路也不能发SCI。尽管不是冲着高分文章这个分析对我们的研究也是有很大的帮助,主要是进化分析自身的意义。高通量测序技术和信息技术的发展为我们提供了海量数据库资源,利用这些数据结合自己的研究课题,快速在目标物种中确定与目标性状有关的基因家族成员有助于缩小研究范围,节省实验成本;了解基因的进化历史,以便为遗传修改提供指导(Tet1-3基因的功能鉴定,催发一系列CNS);确定研究物种是否具有特有的基因家族分支,从而推测其分子生物学过程的变化(不同Cas9类似蛋白的鉴定);鉴定保守的和有变化的调控区域,发现处于进化临界点的调控特征 (Cell上蛇脚退化的机制)……