序列比对包括序列之间的比较分析和序列组成和特征分析。
0️⃣ 序列比对的概念
1️⃣ 序列获取：
- 序列获取(1):DNA
- 序列获取(2):RNA
- 序列获取(3):蛋白质
2️⃣ 双序列比对
双序列比对算法
3️⃣ 多序列比对
1 多序列比对简介
2 多序列比对方法
3 常用工具和数据库
4️⃣ 核酸序列特征分析
1 基因开放阅读框的识别
2 内含子/外显子剪切位点的识别
3 序列motif的查找和可视化工具
4 密码子使用模式的分析
5 限制性内切酶位点分析
6 重复序列的查找
5️⃣ 蛋白质序列特征分析
1 蛋白质的理化性质分析
2蛋白质的跨膜结构分析
3蛋白质信号肽的预测和识别
4蛋白质的卷曲螺旋预测
5糖基化位点的预测与识别
6磷酸化位点的预测与识别
6️⃣ 应用实例
1Spidey工具识别mRNA/cDNA的外显子组成
2Spidey工具进行可变剪切的分析
主要源自李霞老师主编《生物信息学理论与医学实践》，同时综合其他内容。
