序列比对和序列特征分析总目录
1 DNA序列组分分析
DNA的物理化学性质主要由碱基组成决定，有两种方法表示：碱基比例base ratio和GC百分含量简称GC含量GC content
原核生物的GC含量介于25%到75%之间，据此可以识别菌种。
真核生物的GC含量不如原核明显，但基因组不同区域的GC含量存在差异。
GC含量与没密码子使用频率有关，还影响DNA的解链温度。
可以用以下两个在线工具分析DNA序列组成，同时这两个网站还有其他功能。分别是
BioEdit
BioEdit功能十分强大，组成分析只是其中一个小的功能
DNAMAN
BioEdit实例：
BioEdit
Result
2 DNA序列转换
因为DNA序列有双链性，双链互补性及ORF在两条链上存在的特性，所以进行序列分析时，经常要对DNA进行格式转换，比如反向序列，互补序列，反向互补序列，显示DNA双链，转换为RNA等。
软件有
- DNASTAR 核酸和蛋白质序列的综合分析工具
- BioEdit
- DNAMAN等。
