岩酱的生信学习笔记Day7(基因测序原理)

2024-04-19 22:27:06 浏览数 (1)

二代测序数据初步分析

下载安装fastqc

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wget http://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/fastqc/fastqc_v0.11.7.zip
unzip fastqc_v0.11.7.zip
cd FastQC
chmod755 fastqc # chmod权限管理命令,chmod 用3个数字来表达对 用户(文件或目录的所有者),用户组(同组用户),其他用户 的权限:如:chmod 755 fastqc数字7是表达同时具有读,写,执行权限:(7 = 4   2  1)

将fastqc文件夹导入环境变量

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echo 'export PATH=/YOUR/FASTQC PATH/:$PATH' >> ~/.bashrc
source ~/.bashrc

检查是否安装成功fataqc --help出现帮助信息就表示成功。

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