二代测序数据初步分析
下载安装fastqc
代码语言:txt复制wget http://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/fastqc/fastqc_v0.11.7.zip
unzip fastqc_v0.11.7.zip
cd FastQC
chmod755 fastqc # chmod权限管理命令,chmod 用3个数字来表达对 用户(文件或目录的所有者),用户组(同组用户),其他用户 的权限:如:chmod 755 fastqc数字7是表达同时具有读,写,执行权限:(7 = 4 2 1)
将fastqc文件夹导入环境变量
代码语言:txt复制echo 'export PATH=/YOUR/FASTQC PATH/:$PATH' >> ~/.bashrc
source ~/.bashrc
检查是否安装成功fataqc --help出现帮助信息就表示成功。