在https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/
中找到最新的 https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-py39_4.9.2-Linux-x86_64.sh
代码语言:txt复制cd biosoft
先进入biosoft文件夹
代码语言:txt复制wget https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-py39_4.9.2-Linux-x86_64.sh
下载Miniconda3-py39_4.9.2-Linux-x86_64.sh
bash Miniconda3-py39_4.9.2-Linux-x86_64.sh
看到“Thank you for installing Miniconda3 !”说明安装成功
代码语言:txt复制source ~/.bashrc #激活conda的代码,注意空格
conda #出现满屏的信息说明成功了
# 使用北外的镜像
代码语言:txt复制conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --set show_channel_urls yes
配置镜像
代码语言:txt复制conda list
查看所有的软件
代码语言:txt复制conda install fastqc -y
安装软件
代码语言:txt复制fastqc --help ###帮助文档
参考生信星球学习小组第169期 (umu.cn)