day6-测序知识

2024-05-13 23:35:39 浏览数 (1)

1.测序过程

文章《测序的世界》：https://www.jianshu.com/p/101c14c3a1d2

DNA测序：

一代测序（Sanger测序）

a.多聚核糖核苷酸链的降解法，磷酸单酯酶的脱磷酸作用和高碘酸盐的氧化作用从链末端逐一分离寡核糖核苷酸并测定其种类

b.双脱氧核苷酸ddNTP

c.1983年的Kary Mullis 发明PCR测序仪

二代测序：

Roche公司的454技术、illumina公司的Solexa/Hiseq技术和ABI公司的SOLID技术标志第二代测序技术诞生

介绍Hiseq Pair End双端测序原理

数据分析

登入 切换账号ssh bio05@ip

下载安装

  1. 直接在服务器中wget https://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/fastqc/fastqc_v0.12.1.zip ###在官网复制最新的链接
代码语言：txt复制
##接着安装
unzip fastqc_v0.12.1.zip

代码语言：txt复制
unzip fastqc_v0.12.1.zip
Command 'unzip' not found, but can be installed with:
apt install unzip
Please ask your administrator.

它让我找管理员要权限，好吧那我切换账号，将 bio05 用户添加到 sudoers 文件中

代码语言：txt复制
bio05@ecm-cefa:~$ su -
Password:
su: Authentication failure##密码不对？

卡在这里了

--> cd FastQC -- > chmod755 fastqc

我们换一种方法：下载filezilla导入linux服务器

2.测序类型 生信小白第6天-初涉测序 (qq.com)

DNA 测序技术的发展：第三代测序法 (qq.com) 【陈巍学基因】

参考生信星球学习小组第169期 (umu.cn)

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