1.第一代DNA测序技术桑格尔-双脱氧链终止法
是最为经典的一代测序技术，至今仍是测序行业的金标准。
人类基因组计划（HGP）主要基于第一代测序技术。HGP完成后，进入后基因组时代，成本高、通量低的传统测序技术不能满足深度测序和重复测序等大规模基因组测序的要求。
2.第二代DNA测序技术(next generation sequencing，NGS )-循环阵列合成测序法。
二代测序大幅度提高了测序速度，降低了测序成本（下图），保持了高准确性。缺点是读长短，拼接困难，pcr技术增加了测序的错误率。
3.第三代测序技术
以PacBio公司的SMRT和Oxford Nanopore Technologies 的纳米孔单分子测序技术为标志，不需要经过PCR扩增，超长读长，可达二代测序的100倍以上，实现了对每一条DNA分子的单独测序。错误率比二代要高，达到10-15%。
