先正常下载Seurat
代码语言：r复制BiocManager::install("Seurat")
BiocManager::install("SeuratObject")
#此时的版本
> packageVersion("Seurat")
[1] ‘5.1.0’
> packageVersion("SeuratObject")
[1] ‘5.0.2’
> packageVersion("Matrix")
[1] ‘1.6.1.1’然后单独卸载Seurat和SeuratObject
代码语言：r复制remove.packages("SeuratObject")
remove.packages("Seurat")
#detach(package:Seurat)有可能会用到
#detach(package:SeuratObject)可以选择在github上下载（经过尝试不太成功）
代码语言：r复制devtools::install_version("Seurat",version = "4.1.1")
devtools::install_version("SeuratObject",version = "4.1.3")下载到本地（比较成功的）
代码语言：r复制install.packages("E:/develop/handmake_install_packages/spatstat.core_2.4-4.tar.gz",repos = NULL,type = "source")
install.packages("E:/develop/handmake_install_packages/SeuratObject_4.1.3.tar.gz",repos = NULL,type = "source")
install.packages("E:/develop/handmake_install_packages/Seurat_4.1.1.tar.gz",repos = NULL,type = "source")
install.packages("E:/develop/handmake_install_packages/Matrix_1.5-4.tar.gz",repos = NULL,type = "source")
顺序不可以错，否则会出现若干报错
ERROR: dependencies 'SeuratObject', 'spatstat.core' are not available for package 'Seurat'此处的E:/develop/handmake_install_packages请更改为你本人安装这几个软件包的路径，如果直接复制windows的路径，记得改右斜杠“”为左斜杠“/”
再分别检查四个R包的版本
代码语言：r复制> packageVersion("Seurat")
[1] ‘4.1.1’
> packageVersion("SeuratObject")
[1] ‘4.1.3’
> packageVersion("Matrix")
[1] ‘1.5.4’
> packageVersion("spatstat.core")
[1] ‘2.4.4’一句话总结
先通过biocmanager下载seurat等相关的依赖包，然后单独卸载Seurat、SeuratObject，但因为安装SeuratObject需要的Matrix软件包的版本为1.5-4，而下载Matrix过程中又要依赖spatstat.core软件包，因此在本地或者github下载这几个包。
