关键词：肿瘤测序；基因测序；变异检测；
文献简介
- 标题（英文）：Knockdown of NUSAP1 inhibits cell proliferation and invasion through downregulation of TOP2A in human glioblastoma
- 标题（中文）：敲减通过控制TOP2A下调的NUSAP1可以抑制人胶质母细胞瘤的细胞增殖和侵袭
- 发表期刊：Cell Cycle
- 作者单位：山东大学齐鲁医院等
- 发表年份：2022
- 文章地址：https://doi.org/10.1080/15384101.2022.2074199
图1 文献简介多形性胶质母细胞瘤（GBM）是最恶性的原发性人脑肿瘤类型，其特征是增殖率高，预后不良，其中 5 年生存率仍然低于 5%。在过去的40年中，已经实施了多种治疗方式来提高生存率。然而，由于GBM的高侵入性，肿瘤组织不能通过手术完全切除，从而导致肿瘤复发。
核仁和纺锤体相关蛋白 1 （NUSAP1） 是一种不可或缺的有丝分裂调节因子，据报道参与几种类型癌症的发展、进展和转移。
在本研究中，研究者研究了NUSAP1在人GBM中的表达和功能。研究者首先分析了公开数据库中的分子和临床数据，发现NUSAP1表达在GBM组织样本和GBM细胞系中显着上调。随后，在体外和体内模型中使用敲低策略来探索NUSAP1在GBM中的功能，并鉴定可能介导NUSAP1功能的共调控分子，例如拓扑异构酶2A（TOP2A）。该研究的研究结果为治疗GBM的新型靶向治疗提供了一种潜在的策略。
测序流程
样本转录组分析过程中，研究者使用Sentieon软件进行SNV和InDels检测分析。
图2 sentieon的作用
图3 NUSAP1表达在高级别胶质瘤中上调,并与胶质母细胞瘤患者预后呈负相关Sentieon软件团队拥有丰富的软件开发及算法优化工程经验，致力于解决生物数据分析中的速度与准确度瓶颈，为来自于分子诊断、药物研发、临床医疗、人群队列、动植物等多个领域的合作伙伴提供高效精准的软件解决方案，共同推动基因技术的发展。 截至2023年3月份，Sentieon已经在全球范围内为1300 用户提供服务，被世界一级影响因子刊物如NEJM、Cell、Nature等广泛引用，引用次数超过700篇。此外，Sentieon连续数年摘得了Precision FDA、Dream Challenges等多个权威评比的桂冠，在业内获得广泛认可。
文献讨论
图4 文献讨论在功能研究中,敲低NUSAP1抑制了GBM细胞在体外和体内的生长。最后,NUSAP1的缺失触发了细胞凋亡,这可能是由于TOP2A的同时缺失所致。这些结果表明,NUSAP1可能在人类GBM的发展中起到癌基因的作用,并可能作为该疾病治疗的一个新型分子靶点。
总结
综上所述，该研究证明了NUSAP1可能通过触发细胞凋亡来抑制体外和体内GBM细胞的增殖和侵袭。诱导细胞凋亡可能是由于伴随TOP2A表达的下调。因此，该研究为NUSAP1在人GBM发展中可能的致癌作用提供了新的见解，并进一步证明了沉默NUSAP1在恶性人脑肿瘤中的治疗相关性。
