生信星球 Day 4 —— 橙子

源自生信星球，由于有R基础，内容1、2、3跳过了

基础代码

1、显示文件列表（右下角窗口file直接有显示，在R中其实不那么重要）

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dir()
list.files()

2、显示历史命令（右上角history也有）

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history()

就像view(a)可以直接点击environment中的a一样

绘图基础ggplot2

1、ggplot2的内置数据框mpg（需library(ggplot2)才能读取）

拿到一个数据首先就要观察它！

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?mpg   #查看帮助文档

查看每列的非重复值及每个值的重复次数(直接用base的table(mpg$manufacturer)感觉效果类似)

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#用dplyr包的distinct函数
p<-mpg
library(dplyr)
distinct(p,manufacturer) #manufacturer替换为其他列名。仅显示非重复值，不显示重复次数。
count(p,manufacturer) #显示出现次数

2、入门级ggplot2模板（大写部分可替换）

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ggplot(data = MPG) 
    geom_POINT(mapping = aes(x=DISPL, y=HWY))

3、完整版ggplot2模板

① 属性们：

颜色 color

大小 size

形状 shape

透明度 alpha（0.5，not 50%）

填充颜色 fill（针对shape=21-24）

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ggplot(data = mpg) 
  geom_point(mapping = aes(x=displ,
                           y=hwy),
             color='blue',
             size=2,
             shape=16,
             alpha=0.8)

映射：按data.frame的某一列值来定义对应图的某属性（要是离散型变量）

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ggplot(data = mpg) 
  geom_point(mapping = aes(x=displ,y=hwy,color=class))

ggplot详解有些长，day5继续

ggplot2

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