GEO数据库 概述

2023-10-31 17:50:13 浏览数 (2)

go分析、kegg分析

1、gene ratio(DE results)

gene ratio 是在该通路的差异基因与总差异基因的比值

2、bg ratio(organism-specific background)

bg ratio 是数据库中这条通路总共的基因比数据库中总共收录的基因

要注意,差异基因也是数据库中收录的基因

富集分析可视化分析

通路间的共同基因

展示共同基因的图展示共同基因的图
同上,点的颜色表示adjp 线的颜色表示不同通路同上,点的颜色表示adjp 线的颜色表示不同通路

GO term

有颜色的点表示富集到的通路,而灰色的点表示并没有富集到,但是大多数富集到的通路与其有密切关系有颜色的点表示富集到的通路,而灰色的点表示并没有富集到,但是大多数富集到的通路与其有密切关系

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