CNGBdb有哪些实用科学数据库?【小麦基因组变异与选择信号数据库】 | CNGBdb-Question Time

2023-11-01 16:20:53 浏览数 (2)

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09 /WGVD

小麦基因组变异与选择信号数据库

db.cngb.cn/WGVD/

WGVD由西北农林科技大学康振生院士团队和姜雨教授团队构建,包括面包小麦及其祖先的全基因组重测序和外显子捕获数据的基因组变异,以及小麦驯化和改良期间的全基因组选择性信号,促进小麦的功能及育种研究。

数据资源

WGVD汇总了从968个面包小麦及其祖先中收集到的SNPs、indels,以及基于93个小麦全基因组重测数据的SNPs评估的小麦驯化和改良过程中的选择特征。在目前的版本中,WGVD包括7,346,814个SNP和1,044,400个indel,重点关注基因区以及上游/下游区域。

主要功能

WGVD可以通过用户友好的界面访问,提供四个主要功能:变异搜索、基因组选择信号搜索、基因组浏览器和比对工具(BLAST)

功能详情

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