生信星球学习小组Day5-云朵

2023-11-04 09:57:53 浏览数 (3)

今天的重点是了解数据结构,又是充电的一天~

# 1. 了解数据类型

> (1)R的赋值符号是**<-**

> (2)在Console 控制台输入命令,相当于Linux的命令行 

> (3)R的代码都是**带括号**的,括号必须是英文

> (4)显示工作路径 getwd()

> (5)向量是由元素组成的,元素可以是**数字或者字符串**

> (6)表格在R语言中改名叫**数据框**

> (7)别只复制代码,要理解其中的命令、函数的意思。函数或者命令不会用时,可用这个命令查看帮助:?read.table,调出对应的帮助文档,翻到example部分研究一下。

> (8)数据类型:向量(vector),数据框(Data frame)*重要*

# 2.向量

## 2.1.标量和向量的区分

元素指的是数字或者字符串(用chr表示)等

> 标量:一个元素组成的变量

> 向量:多个元素组成的变量(是一排有序排列的元素)

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使用时,一般都会直接给变量定义,也就是“赋值”,数值、字符串、数据框等

代码语言:javascript复制
x<- 1:10 #从1-10之间所有的整数
x<- seq(1,10,by = 0.5) #1-10之间每隔0.5取一个数(注意是逗号不是分号)
x<- rep(1:3,times=2) #1-3 重复2次

*注:x的赋值为最后一次的结果*

## 2.2 从向量中提取元素

(1)根据位置
代码语言:javascript复制
#这里的x是你刚才赋值的变量名,根据自己的情况来修改
x[4] #x第4个元素
x[-4]#排除法,除了第4个元素之外剩余的元素
x[2:4]#第2到4个元素
x[-(2:4)]#除了第2-4个元素
x[c(1,5)] #第1个和第5个元素
(2)根据值
代码语言:javascript复制
x[x==10]#等于10的元素, *两个等号*
x[x<0]
x[x %in% c(1,2,5)]#存在于向量c(1,2,5)中的元素

# 3. 数据框

将示例数据放在你的工作目录下

新建yunduo.txt,默认在工作目录下新建

用以下命令即可获得示例数据框:

'''X<-read.csv('doudou.txt')'''

## 3.1 读取本地数据

huahua.txt放在工作目录里

read.table(file = "huahua.txt"sep""t",header =T)

a<-read.table(file = "huahua.txt"sep""t",header =T)

sep=t #目的为识别行

header=T #目的为把第一行设置为表头

## 3.2 设置行名和列名

X<-read.csv('doudou.txt') #在示例数据里有doudou.txt 注意这里的变量X是一个数据框

colnames(X) #查看列名

rownames(X) #查看行名,默认值的行名就是行号,1.2.3.4...

colnames(X)[1]<-"bioplanet"#有的公司返回数据,左上角第一格为空,R会自动补为x,用这个命令来修改

X<-read.csv(file = "huahua.txt",sep = " ",header =T,row.names=1)#最后row.names的意思是修改第一列为行名

## 3.3 数据框的导出

write.table(X,file = "yu.txt",sep = ",",quote=F)#分隔符改为逗号,字符串不加双引号(默认格式带由双引号) 

## 3.4 变量的保存与重新加载

save.image(file="bioinfoplanet.RData")#保存当前所有变量

save(X,file="test.RData")#保存其中一个变量

load("test.RData")#再次使用RData时的加载命令

## 3.5 提取元素

-X[x,y]#第x行第y列

- X[x,]#第x行

- X[,y]#第y列

- X[y] #也是第y列

- X[a:b]#第a列到第b列

- X[c(a,b)]#第a列和第b列

- X$列名#也可以提取列(不用写括号,支持Tab自动补全哦,不过只能提取一列)

## 3.6 直接使用数据框中的变量

plot(iris$Sepal.Length,iris$Sepal.Width)

save(X,file="test.RData")#储存到Rdata文件夹里,是R语言特有的数据存储格式,无法用其他软件打开,保存的是变量,不是表格文件

如果报错object X not found,可能是区分大小写的问题,或者不在工作目录

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