揭开K8s适配CgroupV2内存虚高的迷局

2023-11-15 18:45:04 浏览数 (1)

在Almalinux替换CentOS的过程中，我们通过kubectl top nodes命令观察到了两个相同规格的节点（只有cgroup版本不同）。在分别调度两个相同的Pod后，我们预期它们的内存使用量应该相近。然而，我们发现使用了cgroupv2的节点的内存使用量比使用了cgroupv1的节点多了约280Mi。

编辑｜zouyee

初步分析表明，可能是cAdvisor在统计cgroupv1和v2的内存使用量时存在逻辑上的不一致。

理论上，无论使用cgroupv1还是cgroupv2，两个相同配置的节点的内存使用量应该相近。实际上，在比较/proc/meminfo时，我们发现了总内存使用量近似的情况。那么问题出在哪里呢？

我们发现，这个问题只影响了节点级别的内存统计数据，而不影响Pod级别的统计数据。

问题的根本原因是cAdvisor调用了runc的接口，其计算root cgroup的内存数据方面存在差异。在cgroupv2中，root cgroup不存在memory.current这个文件，但在cgroupv1中root cgroup是存在memory.usage_in_bytes文件的。这导致了在统计cgroupv2内存使用量时出现了不一致的情况。

这个问题可能需要在cAdvisor或runc的逻辑中进行修复，以确保在cgroupv1和cgroupv2中的内存统计一致性。下面我们基于社区issue展开介绍。

v1.28.3 commit:a8a1abc25cad87333840cd7d54be2efaf31a3177

NOTE: Containerd:1.6.21，K8s:1.28, Kernel:5.15.0

技术背景

在Kubernetes中，Google的cAdvisor项目被用于节点上容器资源和性能指标的收集。在kubelet server中，cAdvisor被集成用于监控该节点上kubepods（默认cgroup名称，systemd模式下会加上.slice后缀） cgroup下的所有容器。从1.29.0-alpha.2版本中可以看到，kubelet目前还是提供了以下两种配置选项（但是现在useLegacyCadvisorStats为false）：

代码语言：javascript复制
if kubeDeps.useLegacyCadvisorStats {
    klet.StatsProvider = stats.NewCadvisorStatsProvider(
      klet.cadvisor,
      klet.resourceAnalyzer,
      klet.podManager,
      klet.runtimeCache,
      klet.containerRuntime,
      klet.statusManager,
      hostStatsProvider)
  } else {
    klet.StatsProvider = stats.NewCRIStatsProvider(
      klet.cadvisor,
      klet.resourceAnalyzer,
      klet.podManager,
      klet.runtimeCache,
      kubeDeps.RemoteRuntimeService,
      kubeDeps.RemoteImageService,
      hostStatsProvider,
      utilfeature.DefaultFeatureGate.Enabled(features.PodAndContainerStatsFromCRI))
  }

kubelet以Prometheus指标格式在/stats/暴露所有相关运行时指标，如下图所示，Kubelet内置了cadvisor服务

从 Kubernetes 1.12 版本开始，kubelet 直接从 cAdvisor 暴露了多个接口。包括以下接口：

  1. cAdvisor 的 Prometheus 指标位于 /metrics/cadvisor。
  2. cAdvisor v1 Json API 位于 /stats/、/stats/container、/stats/{podName}/{containerName} 和 /stats/{namespace}/{podName}/{uid}/{containerName}。
  3. cAdvisor 的机器信息位于 /spec。

此外，kubelet还暴露了summary API，其中cAdvisor 是该接口指标来源之一。在社区的监控架构文档中描述了“核心”指标和“监控”指标的定义。这个文档中规定了一组核心指标及其用途，并且目标是通过拆分监控架构来实现以下两个目标：

  1. 减小核心指标的统计收集性能影响，允许更频繁地收集这些指标。
  2. 使监控方案可替代且可扩展。

因此移除cadvisor的接口，成了一项长期目标，目前进度如下(进度状态的标记略为滞后)：

  • [1.13] 引入 Kubelet 的 pod-resources gRPC 端点；KEP: 支持设备监控社区#2454
  • [1.14] 引入 Kubelet 资源指标 API
  • [1.15] 通过添加和弃用 --enable-cadvisor-json-endpoints 标志，废弃“直接” cAdvisor API 端点
  • [1.18] 默认将 --enable-cadvisor-json-endpoints 标志设置为禁用
  • [1.21] 移除 --enable-cadvisor-json-endpoints 标志
  • [1.21] 将监控服务器过渡到 Kubelet 资源指标 API（需要3个版本的差异）
  • [TBD] 为 kubelet 监控端点提出外部替代方案
  • [TBD] 通过添加和废弃 --enable-container-monitoring-endpoints 标志，废弃摘要 API 和 cAdvisor Prometheus 端点
  • [TBD 2] 移除“直接”的 cAdvisor API 端点
  • [TBD 2] 默认将 --enable-container-monitoring-endpoints 标志设置为禁用
  • [TBD 4] 移除摘要 API、cAdvisor Prometheus 指标和移除 --enable-container-monitoring-endpoints 标志。

当前版本的cadvisor接口已经做了部分废弃，例如/spec及/stats/*等

寻根溯源

kubelet 使用 cadvisor 来获取节点级别的统计信息（无论是使用 cri 还是通过cadvisor 来统计提供程序来获取 pod 的统计信息）：

代码语言：javascript复制
kubernetes/pkg/kubelet/stats/provider.go


 // NewCRIStatsProvider returns a Provider that provides the node stats 
 // from cAdvisor and the container stats from CRI. 
 func NewCRIStatsProvider( 
   cadvisor cadvisor.Interface, 
   resourceAnalyzer stats.ResourceAnalyzer, 
   podManager PodManager, 
   runtimeCache kubecontainer.RuntimeCache, 
   runtimeService internalapi.RuntimeService, 
   imageService internalapi.ImageManagerService, 
   hostStatsProvider HostStatsProvider, 
   podAndContainerStatsFromCRI bool, 
 ) *Provider { 
   return newStatsProvider(cadvisor, podManager, runtimeCache, newCRIStatsProvider(cadvisor, resourceAnalyzer, 
     runtimeService, imageService, hostStatsProvider, podAndContainerStatsFromCRI)) 
 } 
  
 // NewCadvisorStatsProvider returns a containerStatsProvider that provides both 
 // the node and the container stats from cAdvisor. 
 func NewCadvisorStatsProvider( 
   cadvisor cadvisor.Interface, 
   resourceAnalyzer stats.ResourceAnalyzer, 
   podManager PodManager, 
   runtimeCache kubecontainer.RuntimeCache, 
   imageService kubecontainer.ImageService, 
   statusProvider status.PodStatusProvider, 
   hostStatsProvider HostStatsProvider, 
 ) *Provider { 
   return newStatsProvider(cadvisor, podManager, runtimeCache, newCadvisorStatsProvider(cadvisor, resourceAnalyzer, imageService, statusProvider, hostStatsProvider)) 
 }

可以通过下述两种方式获取节点的内存使用情况

代码语言：javascript复制
kubectl top node 
kubectl get --raw /api/v1/nodes/foo/proxy/stats/summary | jq -C .node.memory

结果显示cgroupv2节点的内存使用量比相同节点配置但使用 cgroupv1的高一些。kubectl top node 获取节点信息的逻辑在：https://github.com/kubernetes-sigs/metrics-server/blob/master/pkg/storage/node.go#L40

kubelet使用 cadvisor 来获取 cgroup 统计信息：

代码语言：javascript复制
kubernetes/pkg/kubelet/server/stats/summary.go

 rootStats, err := sp.provider.GetCgroupCPUAndMemoryStats("/", false) 
 if err != nil { 
   return nil, fmt.Errorf("failed to get root cgroup stats: %v", err) 
 }

这里GetCgroupCPUAndMemoryStats调用以下cadvisor逻辑

代码语言：javascript复制
kubernetes/pkg/kubelet/stats/helper.go

 infoMap, err := cadvisor.ContainerInfoV2(containerName, cadvisorapiv2.RequestOptions{ 
   IdType:    cadvisorapiv2.TypeName, 
   Count:     2, // 2 samples are needed to compute "instantaneous" CPU 
   Recursive: false, 
   MaxAge:    maxAge, 
 })

cadvisor 基于 cgroup v1/v2 获取不同 cgroup manager接口实现，然后调用GetStats()获取监控信息。

这些实现在计算root cgroup 的内存使用方面存在差异。

v1 使用来自 memory.usage_in_bytes 的内存使用情况：https://github.com/opencontainers/runc/blob/92c71e725fc6421b6375ff128936a23c340e2d16/libcontainer/cgroups/fs/memory.go#L204-L224

v2 使用 /proc/meminfo 并计算使用情况为总内存 - 空闲内存：https://github.com/opencontainers/runc/blob/92c71e725fc6421b6375ff128936a23c340e2d16/libcontainer/cgroups/fs2/memory.go#L217

usage_in_bytes 大致等于 RSS Cache。workingset是 usage - 非活动文件。

在 cadvisor 中，在workingset中排除了非活动文件：https://github.com/google/cadvisor/blob/8164b38067246b36c773204f154604e2a1c962dc/container/libcontainer/handler.go#L835-L844"

因此可以判断在cgroupv2计算内存使用使用了total-free，这里面包含了inactive_anon，而内核以及cgroupv1计算内存使用量时不会计入 inactive_anon：https://git.kernel.org/pub/scm/linux/kernel/git/torvalds/linux.git/tree/mm/memcontrol.c#n3720

通过下面的测试中，inactive_anon 解释数据看到了差异。

下述分别为cgroupv1及cgroupv2的两个集群

代码语言：javascript复制
~ # kubectl top node
NAME    CPU(cores)   CPU%   MEMORY(bytes)   MEMORY%
node1   98m          2%     1512Mi          12%
node2   99m          2%     1454Mi          11%
node3   94m          2%     1448Mi          11%

其中cgroupv1节点的root cgroup内存使用如下：

代码语言：javascript复制
~ # cat /sys/fs/cgroup/memory/memory.usage_in_bytes
6236864512
~ # cat /sys/fs/cgroup/memory/memory.stat
cache 44662784
rss 3260416
rss_huge 2097152
shmem 65536
mapped_file 11083776
dirty 135168
writeback 0
pgpgin 114774
pgpgout 103506
pgfault 165891
pgmajfault 99
inactive_anon 135168
active_anon 3645440
inactive_file 5406720
active_file 39333888
unevictable 0
hierarchical_memory_limit 9223372036854771712
total_cache 5471584256
total_rss 767148032
total_rss_huge 559939584
total_shmem 1921024
total_mapped_file 605687808
total_dirty 270336
total_writeback 0
total_pgpgin 51679194
total_pgpgout 50291069
total_pgfault 97383769
total_pgmajfault 5610
total_inactive_anon 1081344
total_active_anon 772235264
total_inactive_file 4648124416
total_active_file 820551680
total_unevictable 0

meminfo文件如下

代码语言：javascript复制
~ # cat /proc/meminfo
MemTotal:       16393244 kB
MemFree:         9744148 kB
MemAvailable:   15020900 kB
Buffers:          132344 kB
Cached:          5207356 kB
SwapCached:            0 kB
Active:          1557252 kB
Inactive:        4526668 kB
Active(anon):     745916 kB
Inactive(anon):      792 kB
Active(file):     811336 kB
Inactive(file):  4525876 kB
Unevictable:           0 kB
Mlocked:               0 kB
SwapTotal:             0 kB
SwapFree:              0 kB
Dirty:               636 kB
Writeback:             0 kB
AnonPages:        618992 kB
Mapped:           624384 kB
Shmem:              2496 kB
KReclaimable:     285824 kB
Slab:             423600 kB
SReclaimable:     285824 kB
SUnreclaim:       137776 kB
KernelStack:        8400 kB
PageTables:         9060 kB
NFS_Unstable:          0 kB
Bounce:                0 kB
WritebackTmp:          0 kB
CommitLimit:     8196620 kB
Committed_AS:    2800016 kB
VmallocTotal:   34359738367 kB
VmallocUsed:       40992 kB
VmallocChunk:          0 kB
Percpu:             4432 kB
HardwareCorrupted:     0 kB
AnonHugePages:    270336 kB
ShmemHugePages:        0 kB
ShmemPmdMapped:        0 kB
FileHugePages:         0 kB
FilePmdMapped:         0 kB
CmaTotal:              0 kB
CmaFree:               0 kB
HugePages_Total:       0
HugePages_Free:        0
HugePages_Rsvd:        0
HugePages_Surp:        0
Hugepagesize:       2048 kB
Hugetlb:               0 kB
DirectMap4k:      302344 kB
DirectMap2M:     3891200 kB
DirectMap1G:    14680064 kB

当前的计算

memory.current - memory.stat.total_inactive_file = 6236864512 - 4648124416 = 1515 Mi -> kubelet 报告的结果

cgroupv2 集群

代码语言：javascript复制
~ # kubectl top node
NAME    CPU(cores)   CPU%   MEMORY(bytes)   MEMORY%
node1   113m         2%     2196Mi          17%
node2   112m         2%     2171Mi          17%
node3   113m         2%     2180Mi          17%

其中一节点的meminfo文件如下：

代码语言：javascript复制
MemTotal:       16374584 kB
MemFree:         9505980 kB
MemAvailable:   14912544 kB
Buffers:          155164 kB
Cached:          5335576 kB
SwapCached:            0 kB
Active:           872420 kB
Inactive:        5399340 kB
Active(anon):       2568 kB
Inactive(anon):   791340 kB
Active(file):     869852 kB
Inactive(file):  4608000 kB
Unevictable:       30740 kB
Mlocked:           27668 kB
SwapTotal:             0 kB
SwapFree:              0 kB
Dirty:               148 kB
Writeback:             0 kB
AnonPages:        716552 kB
Mapped:           608424 kB
Shmem:              6320 kB
KReclaimable:     274360 kB
Slab:             355976 kB
SReclaimable:     274360 kB
SUnreclaim:        81616 kB
KernelStack:        8064 kB
PageTables:         7692 kB
NFS_Unstable:          0 kB
Bounce:                0 kB
WritebackTmp:          0 kB
CommitLimit:     8187292 kB
Committed_AS:    2605012 kB
VmallocTotal:   34359738367 kB
VmallocUsed:       48092 kB
VmallocChunk:          0 kB
Percpu:             3472 kB
HardwareCorrupted:     0 kB
AnonHugePages:    409600 kB
ShmemHugePages:        0 kB
ShmemPmdMapped:        0 kB
FileHugePages:         0 kB
FilePmdMapped:         0 kB
HugePages_Total:       0
HugePages_Free:        0
HugePages_Rsvd:        0
HugePages_Surp:        0
Hugepagesize:       2048 kB
Hugetlb:               0 kB
DirectMap4k:      271624 kB
DirectMap2M:     8116224 kB
DirectMap1G:    10485760 kB

usage = total - free = 16374584 - 9505980

workingset = 总内存 - 空闲内存 - 非活动文件 = 16374584 - 9505980 - 4608000 = 2207 Mi（kubelet 报告的结果）

结论

如上所述，在Linux kernel及runc cgroupv1计算内存使用为

代码语言：javascript复制
mem_cgroup_usage =NR_FILE_PAGES   NR_ANON_MAPPED   nr_swap_pages (如果swap启用的话)

// - rss (NR_ANON_MAPPED)
// - cache (NR_FILE_PAGES)

但是runc在cgroupv2计算使用了total-free，因此在相似负载下，同一台机器上v1和v2版本的节点级别报告确实会相差约250-750Mi，为了让cgroup v2的内存使用计算更接近 cgroupv1， cgroup v2调整计算内存使用量方式为

代码语言：javascript复制
stats.MemoryStats.Usage.Usage = stats.MemoryStats.Stats["anon"]   stats.MemoryStats.Stats["file"]

当然，我们同时还需要处理cadvisor的woringset的处理逻辑

由于笔者时间、视野、认知有限，本文难免出现错误、疏漏等问题，期待各位读者朋友、业界专家指正交流，上述排障信息已修改为社区内容。

参考文献

1.https://github.com/torvalds/linux/blob/06c2afb862f9da8dc5efa4b6076a0e48c3fbaaa5/mm/memcontrol.c#L3673-L3680

2.https://github.com/kubernetes/kubernetes/issues/68522

3.https://kubernetes.io/docs/reference/instrumentation/cri-pod-container-metrics/

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