生信提升day3

2023-11-15 22:14:47 浏览数 (1)

查看服务器 uname -a

1.

好的,是你64-bit(x86_64)

2.

3.下载成功未安装,需要运行这句代码(问啥回答啥)

代码语言:txt复制
bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh 

4.source ~/.bashrc激活conda

出现满屏信息未报错,说明成功

5.镜像 # 使用北外的镜像

conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/

conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/

conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/free/

conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/main/

conda config --set show_channel_urls yes

使用conda

  1. 查看当前服务器上安装的所有软件列表 conda list
  2. 安装软件 conda install fastqc -y 3尝试不加y,好吧,我也看不懂,反正就是不成功
  1. 卸载软件 conda remove fastqc -y(先不试)

选修

conda 环境 分身就是不同的“conda environment”为了满足不同项目需要的相同软件的不同版本

1.查看conda有哪些环境(带*已激活)

2.创建也成功了

3.成功成功,芜湖~

4.退出当前环境conda deactivate

代码引用生信星球,说明部分引用生信星球

心得,感觉今天比昨天简单,嘻嘻~

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