出版级PCA美图,轻松拿捏(主成分分析利器,建议收藏备用)

2023-11-20 13:11:55 浏览数 (2)

功能描述

这个工具用于进行主成分分析(PCA, Principal Component Analysis),可生成出版级图形。

工具位置

UseGalaxy.cn > RNA-seq > PCA plot with FactoMineR

数据准备

文件1:矩阵文件

  • 第1列:特征,如基因。
  • 第2 - 最后一列:样本的值,如表达量。

文件2:样本信息

  • 第1列:样本ID。
  • 第2列:分组。

使用示例

  • 默认参数

  • 高级设置
    • 边界线形状:多边形

  • 高级设置
    • 边界线形状:无边界线

  • 颜色美学
    • 主题:theme_minimal

  • 颜色美学
    • 调色板为:JCO

  • 图例设置
    • 位置:right

0 人点赞