空间转录组技术应用在动物肿瘤、发育、神经等领域研究突飞猛进，甚至已经可以实现单细胞级空间转录组(百创智造于23年6月发布了百创智造S系列空间转录组细胞分割产品，开启单细胞级空间转录组科研时代)而植物领域中的空间转录组研究结果仍然屈指可数。
对于细胞分割，相比于动物，植物细胞的形态和细胞大小差异巨大，若采取同一细胞尺寸预测分割，将导致分割结果较差；因此，为了更好的匹配植物样本特点，惠及植物领域的相关研究，百创智造针对植物细胞，采用了多尺度递进预测，结合百创智造训练的通用植物分割模型，可以在同一个植物组织贴片中，预测分割不同尺寸的细胞，极大的提高了植物细胞分割的准确性。
百创S系列空间转录组
百创智造自主研发的BMKMANU S系列空间转录组芯片是国内首款基于微孔微珠的亚细胞级空间转录组产品，最高分辨率4.8μm ,并开创性的将组织原片H&E染色，原片荧光染色及原片高通量测序相结合进行精准的细胞分割，实现精准的单细胞级空间转录组测序，极大地推动了基础科研发展，目前在发育疾病、生理学疾病、胚胎发育、干细胞分化、绘制3D图谱、生殖健康、肿瘤等领域广泛应用。
百创S系列空间转录组技术原理图
百创S系列空间转录组（动物）细胞分割实现原理：三图合一
百创智造基于S系列空间芯片的底层设计，开发出了自己的专利技术，可以得到完全没有错误的原片荧光图像以及H&E图像且与芯片完全对齐。基于荧光进行细胞核的定位刻画细胞核的边界；基于HE的校准辅助刻画细胞的边界，通过边界信息映射到芯片上，提取相应位置的测序数据，实现精准的单细胞分割。
百创S系列细胞分割（动物） - 实测案例
鼠脑细胞分割：Number of Cells 75,101；Median Genes per Cells 1,568
Demo数据，鼠脑嗅球：Number of Cells 17,564；Median Genes per Cells 1,142
Demo数据，小鼠睾丸：Number of Cells 137,671；Median Genes per 645
百创空间转录组细胞分割技术已广泛应用于多种动植物组织类型
公司介绍
青岛百创智能制造技术有限公司（简称百创智造），隶属于北京百迈客生物科技有限公司。百迈客生物成立于2009年，是一家提供基因多组学测序服务和单细胞空间组学仪器设备的高新技术企业。业务包括科技服务、智能制造(百创智造)二大板块。百创智造深耕于单细胞及空间技术领域，以相关领域仪器设备、芯片及试剂耗材产品的研发生产和销售为主要业务，致力于提供精准时空组学解决策略。公司拥现有自主研发的基于微孔的亚细胞级空间转录组平台BMKMANU S1000，极速单细胞平台BMKMANU DG1000。
文：百创智造
排版：市场部
