Tips:
1.R的代码都是带括号的,括号必须是英文的
2.显示工作路径
代码语言:txt复制getwd()
3.向量是由元素组成的,元素可以是数字或者字符串
4.表格在R语言中改名叫数据框
向量
元素:数字或者字符串(用chr表示)等,根据它可以区分两个词:
标量:一个元素(数字或者字符串)组成的变量
向量:多个元素(数字或者字符串)组成的变量
(补充:一个向量是一排有序排列的元素,以后会用到把一个向量作为数据框中的一列的情况。c()意思是combine(),将不同元素组合为一个向量)
从向量中提取元素
(1)根据元素位置
代码语言:javascript复制x[4] #x第4个元素
x[-4]#排除法,除了第4个元素之外剩余的元素
x[2:4]#第2到4个元素
x[-(2:4)]#除了第2-4个元素
x[c(1,5)] #第1个和第5个元素
(2)根据值
代码语言:javascript复制x[x==10]#等于10的元素
x[x<0]
x[x %in% c(1,2,5)]#存在于向量c(1,2,5)中的元素
数据框
read_csv是以sep=“,”分隔符的数据的标准读取函数,默认可将,分割符转化为空格,其余按原分割符转过来,不要求每列必须数据对齐,不可有空项
read_table则可以读取以sep=(", or ;or ort) "制表符、逗号、分号等分隔符分隔的数据,要求每列必须数据对齐,不可有空项,需指定sep转换分割符为空格
header=ture or false,true则第一行用于列名称,具体数据从第二行开始,false则第一行即为具体数据
设置行名和列名(用刚才的read.table命令重新赋值一遍,就可以覆盖掉修改的了)
代码语言:javascript复制X<-read.csv('doudou.txt') 注意这里的变量X是一个数据框
colnames(X) #查看列名
rownames(X) #查看行名,默认值的行名就是行号,1.2.3.4...
colnames(X)[1]<-"bioplanet"意思是修改X数据框的第一列名为bioplanet,有的公司返回数据,左上角第一格为空,R会自动补为x,用这个命令来修改
X<-read.csv(file = "huahua.txt",sep = " ",header =T,row.names=1)#最后row.names的意思是修改第一列为行名
数据框的导出
代码语言:javascript复制write.table(X,file = "yu.txt",sep = ",",quote=F)#分隔符改为逗号,字符串不加双引号(默认格式带由双引号)
变量的保存与重新加载
代码语言:javascript复制#这次没有处理完的数据下次想接着用怎么办?--学会保存和重新加载。保存的格式是RData。
save.image(file="bioinfoplanet.RData")#保存当前所有变量
save(X,file="test.RData")#保存其中一个变量
load("test.RData")#再次使用RData时的加载命令
提取元素
代码语言:javascript复制- X[x,y]#第x行第y列
- X[x,]#第x行
- X[,y]#第y列
- X[y] #也是第y列(不带,号单独数字仅代表列数)
- X[a:b]#第a列到第b列(a到b列直接都导出)
- X[c(a,b)]#第a列和第b列(仅限a和b列导出)
- X$列名#也可以提取列(优秀写法,而且这个命令还优秀到不用写括号的地步,并且支持Tab自动补全哦,不过只能提取一列)