什么是conda
Linux中的软件商店
如何下载conda
进入Ubuntu,输入uname -a
,查看服务器位数
安装最新版本,复制下载链接
登陆服务器
- 进入目录
cd biosoft
- input
wget address
安装miniconda
input bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
代码语言:txt复制 bash后面是miniconda的名字
enter 或者 yes
激活
代码语言:txt复制 input`source ~/.bashrc`
添加镜像
使用conda
查看已安装的软件列表
conda list
安装软件
conda install fastqc -y
确认安装成功
fastqc --heip
如果出现一大段文字,则安装成功
卸载软件
conda remove fastqc -y
conda 环境
作用
同时容纳多个版本的软件
查看所处环境
conda info --envs
建立环境
建立一个名为rnaseq的conda环境
conda create -n rna-seq python=3 fastqc trimmomatic -y
激活新建的环境
conda activate rna-seq
此时所处环境由base转移到rna-seq
退出当前环境
conda deactivate